KEGG anotación

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Tengo un conjunto de genes (secuencias de aminoácidos). Quiero encontrar las anotaciones funcionales basados ​​Kegg o identificadores de KO. ¿Hay alguna base de datos KEGG disponible para su descarga? Quiero usar ráfaga con esa base de datos. Además, yo estaba buscando R paquete que me puede ayudar en este sentido.

Espero haber aclarado mi consulta. Gracias por su respuesta de antemano.

Publicado el 19/09/2018 a las 12:59
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KEGG base de datos requiere suscripción:

https://www.bioinformatics.jp/en/keggftp.html

Lista de precios:

https://www.bioinformatics.jp/docs/subscription_schedule.pdf

Si continúa interesado aquí es la lista de los datos disponibles:

https://www.kegg.jp/kegg/download/

secuencias FASTA están aquí:

https://www.kegg.jp/kegg/download/Readme/README.fasta

Respondida el 19/09/2018 a las 13:30
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